Le sol est un endroit où matières minérales et organiques coexistent, où vivent de nombreuses espèces (champignons, micro-organismes, insectes,…), et qui nourrit les végétaux, ancrés via leur système racinaire.
Ces mêmes végétaux vont absorber le CO2 lors de leur photosynthèse, afin de produire l’énergie nécessaire à leur développement.
Une partie du carbone de ces plantes va se retrouver dans le sol : par la croissance, et la mort de la matière végétale, par les exsudats racinaires, des composés carbonés émis par les racines, ou encore par transfert vers des organismes en symbiose (comme la mycorhize, cette association entre une plante et un champignon).
Via les végétaux, il y a donc un apport actif de carbone depuis l’atmosphère vers les sols.
Mais l’inverse est vrai aussi : via la décomposition des matières organiques (ou minéralisation), et la respiration microbiennes, le sol rejette du CO2 dans l’atmosphère.